آنالیز توالی RNA تک سلولی از کلیه انسان حضور گیرنده ACE2 را نشان می دهد: یک مسیر بالقوه از عفونت COVID-19

تاریخ انتشار: یکشنبه 26 مرداد 1399 | امتیاز: Article Rating
زمينه و هدف: يك كورونا ويروس جدید با نام SARS-Cov-2 كه 82٪ شباهت توالي ژنوم را با SARS-CoV دارد ، در اوايل دسامبر سال 2019 در ووهان يافت شد ، كه باعث شیوع اپیدمی بیماری ذات الریه پنومونی ناشی از كورونا ویروس با افزایش چشمگیر تعداد ابتلا شد. چندین اندام در برابر عفونت COVID-19 آسیب پذیر هستند. آسيب حاد كليه (AKI) در بخش هايي از مطالعه موردی خصوصيات بيماران مبتلا به COVID-19 گزارش شده است. این مطالعه با هدف تحلیل مسیر احتمالی ورود SARS-Cov-2 و مکانیسم آن در سطح سلولی انجام شده است.

روش: از تکنیک تعیین توالی RNA تک سلولی (scRNA-seq) برای بدست آوردن شواهدی از مسیر احتمالی و سلولهای بیان کننده ACE2 در سیستم کلیوی برای بیماری زایی زمینه ای آسیب کلیوی ناشی از COVID-19 استفاده شد. کل مراحل تحت R با بسته های Seurat انجام شد. از ژنهای نشانگر کانونی برای تفسیر انواع مختلف سلول استفاده شد.

یافته ها: ده گروه مختلف شناسایی شد و ACE2 به طور عمده در لوله پیچیده نزدیک و سلول های اپیتلیال گلومرولی بیان شد. با توجه به نتایج حاصل از انتولوژی ژن (GO) و آنالیز غنی سازی KEGG ، عدم تعادل بیان ACE2 ، فعال سازی سیستم رنین-آنژیوتانسین (RAS) و فرآیندهای مرتبط با نوتروفیل مسئله اصلی آسیب کلیوی ناشی از COVID-19 بود.

نتيجه گيري: مطالعه ما شواهد سلولي را نشان مي دهد كه SARS-Cov-2 از طريق لوله پیچیده نزدیک ، توبول پروگزيمال ، سلول هاي توبول مستقيم پروگزیمال و سلول هاي جداری گلومرول با استفاده از مسير مربوط به ACE2 به بافت كليه انسان حمله كرده و از پروتئاز سلولي TMPRSS2 آنها براي آغاز کردن استفاده می کند.

Single-cell RNA sequencing analysis of human kidney reveals the presence of ACE2 receptor: A potential pathway of COVID-19 infection
Qiyu He 1 2, Tsz N Mok 1, Liang Yun 3, Chengbo He 4, Jieruo Li 1, Jinghua Pan 1

Abstract
Background: A novel coronavirus called SARS-Cov-2, which shared 82% similarity of genome sequence with SARS-CoV, was found in Wuhan in late December of 2019, causing an epidemic outbreak of novel coronavirus-induced pneumonia with dramatically increasing number of cases. Several organs are vulnerable to COVID-19 infection. Acute kidney injury (AKI) was reported in parts of case-studies reporting characteristics of COVID-19 patients. This study aimed at analyzing the potential route of SARS-Cov-2 entry and mechanism at cellular level.
Method: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) technology was used to obtain evidence of potential route and ACE2 expressing cell in renal system for underlying pathogenesis of kidney injury caused by COVID-19. The whole process was performed under R with Seurat packages. Canonical marker genes were used to annotate different types of cells.
Results: Ten different clusters were identified and ACE2 was mainly expressed in proximal tubule and glomerular parietal epithelial cells. From Gene Ontology (GO) & KEGG enrichment analysis, imbalance of ACE2 expression, renin-angiotensin system (RAS) activation, and neutrophil-related processes were the main issue of COVID-19 leading kidney injury.
Conclusion: Our study provided the cellular evidence that SARS-Cov-2 invaded human kidney tissue via proximal convoluted tubule, proximal tubule, proximal straight tubule cells, and glomerular parietal cells by means of ACE2-related pathway and used their cellular protease TMPRSS2 for priming.
PMID: 32744436
ثبت امتیاز
نظرات
در حال حاضر هیچ نظری ثبت نشده است. شما می توانید اولین نفری باشید که نظر می دهید.
ارسال نظر جدید

تصویر امنیتی
کد امنیتی را وارد نمایید:

آرشیو سالانه
آرشیو سالانه
نظرات خوانندگان
نظرات خوانندگان