وی افزود: استفاده از اين سيستم‌ها براي اولين بار در خاورميانه در مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران راه‌اندازي شده و به صورت خدمات ارائه مي‌شود. مجموعه نرم‌افزاري ARB با داشتن ابزارهاي مناسب و گروه‌هاي داده‌اي آن، امروزه در سراسر جهان به عنوان روشي استاندارد براي آناليز داده‌هاي rRNA در حجم انبوه پذيرفته شده به طوري كه نخستين مقاله اين پروژه كه در سال 2004 توسط Ludwing و همكارانش منتشر شده و  تا كنون بيش از 2800 بار در انتشارات معتبر علمي رفرنس داده شده است.

 

فاضلی در خصوص خدمت کنترل کیفیت توالی 16S rRNA بر اساس ویژگیهای ساختار دوم و ساختارهای حفاظت شده خاطر نشان کرد: شرط اوليه صحيح بودن هر آناليز، صحت و دقت مناسب داده‌هاي ورودي آن است. خطاهاي ناشي از بدخوانش توالي‌هاي DNA در بسياري از موارد منجر به برآورد نادرست از ارتباطات فيلوژنتيك و حتي سرمايه‌گذاري مالي، علمي و زماني غير مفيد در شناسايي گونه‌هاي جديد ميكربي مي‌گردد. در اين ارتباط از آخرين ويرايش‌هاي نرم افزار ARB (نوامبر 2011) و پايگاه‌هاي داده ( جولاي 2012) مطابق با آخرين استانداردهاي اعمال شده استفاده مي‌گردد تا خطاهاي خوانشي كه بر اساس ساختار دوم و يا ويژگي‌هاي حفاظت شده ساختاري در محصولات ژن‌هاي rDNA قابل رديابي هستند، شناسايي شوند.

 

وی تصریح کرد راه اندازی این دو خدمت در حوزه شناسایی میکروارگانیسم ها، گام دیگری در زمینه قطع وابستگی به کشورهای خارجی و کمک به محققان داخلی است.

 

گفتنی است این مرکز آمادگی کامل دارد تا این دوخدمت را به جامعه تحقیقاتی و محققان ارائه نماید. 

پایان مطلب/