استفاده از سلول های بنیادی برای مطالعات اثرات تکوینی DNA نئاندرتال
با ظهور فناوری تولید ارگانوئیدها از سلول های بنیادی، روش دانشمندانی که قصد دارند با هدف بررسی فرایندهای تکوینی تعامل بین ژن ها و تشکیل بافت را رمزگشایی کنند ، به خصوص برای ارگان هایی که بافت اولیه در دسترس نیست،تغییر کرده است. در مطالعه ای جدید محققین سعی در بررسی نقش DNA نئاندرتال در طی تکوین داشته اند.
امتیاز:
به گزارش بنیان به نقل از medicalxpress، دکتر جی گری کمپ در موسسه انسان شناسی تکاملی ماکس پلانک در لایپزیگ ، آلمان و دانشگاه بازل در سوئیس توضیح میدهد: استفاده از ردههای iPSC برای بررسی عملکرد DNA باستانی انسان، رویکردی کمتر توجه شده اما بسیار جالب است. هیچ کس نتوانسته است نقش DNA نئاندرتال را در طول تکوین نشان دهد.
مطالعات نشان می دهد که حدود دو درصد از ژنومهای انسانهای مدرن خارج از آفریقا، از DNA نئاندرتال تشکیل شده است. این DNA باستانی، نتیجه جفت گیری بین دو گروه، در دهها هزار سال پیش است.
در مطالعه ای جدید، محققین از منابع مربوط سلولهای بنیادی پرتوان نیروی انسانی اولیه (HipSci) استفاده کرده اند که کنسرسیوم بین المللی است که داده ها و رده های سلولی را برای تحقیق ارائه می دهد. تقریبا همه داده ها و رده های سلولی موجود در HipSci مربوط به مردم بریتانیا و اخلاف اروپایی های شمالی است. محققین این منابع رده های سلولی را برای محتوای DNA نئاندرتال شان و واریته های نئاندرتال دارای عملکرد برای هر رده سلولی بررسی کردند.
نتایج نشان داد که برخی از آللهای نئاندرتال در این جمعیت دارای فراوانی نسبتاً بالایی هستند. به همین دلیل ، این منبع iPSC حاوی ژنهای خاصی است که برای آللهای نئاندرتال از جمله ژنهای مرتبط با رنگ پوست و مو که در اروپایی ها بسیار شیوع دارد ، هموزیگوت هستند. تیم تحقیقاتی دکتر کمپ از چهار رده سلولی برای تولید ارگانوئیدهای مغزی استفاده کرده و دادههای توالی RNA تک سلولی را برای تجزیه و تحلیل ترکیب سلولهای خود جمع آوری کرد. آنها نشان دادند که این داده های رونویسی میتوانند برای ردیابی RNA مشتق از نئاندرتال در فرایندهای تکوین استفاده شوند. کمپ خاطرنشان كرده است كه این تحقیق می تواند برای مطالعه سایر جمعیت های باستانی بشر از جمله دنیسووانها (Denisovans) که دارای ژنهای جمعیت های اقیانوسی هستند استفاده شود.. تیم وی همچنین قصد دارد تا با استفاده از HipSci و سایر منابع ، به مطالعه آللهای Neandertal ادامه دهد. وی بر این باور است که از این ارگانوئیدها می توان برای مطالعه تعدادی از فرآیندهای مختلف تکوینی و فنوتیپ هایی که توسط DNA نئاندرتال کنترل می شوند ، از جمله دستگاه گوارش ، عملکرد شناختی و عصبی و پاسخ ایمنی به عوامل بیماری زا استفاده کرد.
محققان با استفاده از این اطلاعات ، یک مرورگر وب ایجاد کرده اند تا داده ها را برای تحقیقات آینده به راحتی در دسترس قرار دهد.
پایان مطلب/