ثبت جهاني نخستين تعيين توالي كامل ژنوم باكتريهاي بومي ايران
نتايج توالي يابي ژنوم دو باكتري شور پسند با نامهاي Oceanimonas sp. GK1 و Nesterenkonia sp. Strain: F به عنوان نخستين و تنها پروژه توالي يابي ايراني كه به صورت كامل توسط مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران انجام شده در مركز ملي اطلاعات بيوتكنولوژي آمريكا(NCBI) ثبت و در مجله معتبر بين المللي Journal of Bacteriology چاپ و گزارش شد.
امتیاز:
به گزارش بنیان دكتر سيد ابوالحسن شاهزاده فاضلي، رييس مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران با اعلام اين مطلب گفت: در راستاي رسالت مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران در شناسايي و ذخيره ذخاير ژنتيكي كشور، بانك مولكولي مركز براي نخستين بار در كشور با استفاده از تكنيكهاي توالي يابي پيشرفته (Next Generation Sequencing) به شناسايي و تعيين ترادف ژنومي دو باكتري بومي جداشده از درياچه هاي شور ايران مبادرت ورزيد.
اين دو باكتري شور پسند با نامهاي Oceanimonas sp. GK1 و Nesterenkonia sp. Strain: F طي آزمايشهاي ميكروبيولوژيك به ترتيب داراي توانمندي و قابليت بسيار خوبي در توليد طبيعي پليمر بتا هيدروكسي بوتيرات (PHB) (پلاستيك زيست تخريب پذير) و آنزيم آميلاز تشخيص داده شدند. پليمر PHB و آنزيم آميلاز كاربرد و اهميت فوق العاده اي در صنعت، تحقيقات و حتي پزشكي دارند.
شاهزاده فاضلي افزود: توالي كامل ژنوم اين دو باكتري به اندازه 2812133 جفت باز و تعداد 2484 ژن براي باكتري Nesterenkonia sp. Strain: F و 3514537 جفت باز و تعداد 3338 ژن براي باكتري Oceanimonas sp. GK1 به همراه مشخصات تمام ژنهاي شناسايي شده بر روي آنها، به عنوان اولين ژنوم هاي بومي ايران در پايگاه اطلاعاتي بيوتكنولوژي آمريكا ثبت شده و قابل دسترس است. همچنين نتايج اين تحقيقات در يكي از معتبرترين ژورنالهاي باكتري شناسي دنيا (Journal of Bacteriology) در سال 2011 و 2012 با نشاني دسترسي اينترنتي(Oceanimonas sp. GK1: (http://jb.asm.org/content/194/8/2123.full.pdf) Nesterenkonia sp. Strain: F: (http://jb.asm.org/content/193/19/5580.full.pdf به چاپ رسيده است.
پایان مطلب/